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06278 - Fundamentals of Computational Epidemiology

by Jones Albuquerque last modified 2012-09-02 22:44

Esta disciplina é parte integrante do grupo de pesquisa http://www.epischisto.org em parceria com o CESAR.edu, CPqAM/FIOCRUZ (http://www.cpqam.fiocruz.br/).

NEWS



Tests and Scores


NOTA 1V.A. (Prova individual-70% (são 6-8 notas, descartando as 2 piores)+ trabalhos escolares-30%)
NOTA 2V.A. (Projeto em equipe (duplas)-60% + trabalhos escolares-40%)
NOTA FINAL (Prova oral com todo o conteúdo-100%)



Planning


Class Planning (PLANO DE ENSINO)


Syllabus

Slides, activities, ...

classdate
where
topic/slidesfor home
OBS
110.ago.10cegoe
  1. motivação
  2. projeto xiscanoé
  3. plano de ensino

  1. Leitura Artigo Epidemic Modelling Using CA
NOTA1: entrega por e-mail até às 23h59´59´´ do dia 11.mar.09 para jones.albuquerque@gmail.com com subject: "Resumo Paper Epidemic" e arquivo em anexo .pdf com <nomesobrenome>.pdf contendo resumo de 1 a 2 páginas do artigo.
2
12.ago.10cegoeDiscussão e compreensao do artigo  Epidemic Modelling Using CA

Estudar o jogo definido em GAME OF LIFE

preparar um texto de 2 páginas descrevendo o funcionamento do jogo.

  1. jogo da vida
  2. jogo da vida em excel!
  3. jogo da vida em MATLAB

3
17.ago.10cegoe
Tira-dúvidas e replanejamento

4
19.ago.10cegoe
  1. Discussão sobre o Jogo da Vida
  2. MATHEMATICA - Uma Apostila em Português
  3. Mathematica Tutorial - OFFICIAL
  4. A Brief Introduction to Mathematica
  5. Introduction to Mathematica
Leitura dos Capítulos sobre Esquistossomose e Moluscos transmissoresCadastre-se no Oro-Aro e se inscreva na Comunidade Xiscanoe - Elementos de Epidemiologia Computacional

NOTA 2: descobrir e relatar os comportamentos de dois cenários no Jogo da Vida.
ENTREGA postar como uma história da comunidade de Elementos de Epidemiologia Computacional no Oro-Aro até às 23h59´59´´ do dia 19.mar.09 com título "Comportamentos Game of Life" e anexar arquivo em anexo .pdf com <nomesobrenome>.pdf ou postar diretamente no editor do Oro-Aro  contendo a descrição.
5
21.ago.10cegoe
Laboratório
NOTA 3: postar o seu notebook mathematica com os 9 exercícios do First Calculation
na comunidade da Disciplina no Oro-Aro com o título: "First Calculations" até o dia 24.mar.09 às 23h59´59''

6
26.ago.10
cegoe

  1. aula marco antônio (FIOCRUZ) sobre os moluscos

Nota 4: descrever o comportamento e ciclo de duas doenças contagiosas. ENTREGA postar como uma história da comunidade de Elementos de Epidemiologia Computacional no Oro-Aro até às 23h59´59´´ do dia 31.mar.09 com título "Ciclo de contaminação das doenças <X> e <Y>", anexar arquivo .pdf ou postar diretamente no editor do Oro-Aro.
7
28.ago.10cegoe
Submissões PIBIC/FACEPE e
tira-dúvidas
palestra

“Trajetória, oportunidades e desafios da carreira dos profissionais de TI em Pernambuco – O que mudou em trinta anos?”  no CIn-UFPE, às 15h no Anfiteatro do Cin-UFPE.


8
09.set.10cegoe 

Aula por Elaine de Assis: Introdução a Epidemiologia

Leitura dos Capítulos 1, 2 e 3 do Livro Introdução a Epidemiologia para teste a posteriori
 
14.set.10cegoe
MATHEMATICA - prática
  NOTA 5: os exercícios 1.1 a 1.5 do Numerical Calculations e os exercícios 3.1 a 3.5 do Symbolic Calculations

ENTREGA postar como uma história da comunidade de Modelagem Computacional no Oro-Aro até às 23h59´59´´ do dia 15.abr.09 com título "Numerical and Symbolic Calculations" e anexar arquivo.nb
10
16.set.10cegoe
MATHEMATICA - prática
ENTREGA DE NOTA 4
11

21.set.10

cegoe
Aula: Exemplos de Autômatos Celulares do Projeto Xiscanoé

Autômatos Celulares -

  1. Fundamentos e
  2. Conceitos de Modelagem
  3. O que é epidemiologia


NOTA 6: Ler os dois Capítulos sobre A Esquistossomose e os Moluscos.

ENTREGA postar como uma história da comunidade de Elementos de Epidemiologia no Oro-Aro até às 23h59´59´´ do dia 29.abr.09 com título "Parâmetros de Modelagem da Esquistossomose" e anexar um aqruivo <slides.pdf>.
 
12
23.set.10Cegoe
Discussão e implementação de Modelos
  1. MODELO SIR - Wikipedia
  2. Introdução aos modelos de transmissão de doenças infecciosas - LNCC
NOTA 7: Modelar a célula, o mundo e as transições do ciclo da esquistossomose.

ENTREGA postar como uma história da comunidade de Elementos de Epidemiologia Computacional no Oro-Aro até às 23h59´59´´ do dia 04/mai/09 com título "Modelagem Esquistossomose" e anexar uma apresentação em pdf.
 
1328.set.10cegoe
AULA PRÁTICA - MathematicaNOTA 8 enviar por email para jones.albuquerque@gmail.com um notebook com <nome sobrenome>.nb até o dia 06/mai/09: escolha 3 exercícios de cada grupo
  1. Plotting and Graphics
  2. Using Notebooks
  3. Typeset Editing
  4. Working with Expressions
  5. Programming
  6. Working with Files
e envie!

14
30.set.10cegoeAULA PRÁTICA - Mathematica

 
15 cegoe
FECHAMENTO
1 VA
NOTA 9 testinho sobre mathematica

Entrega de notebooks NOTA 8!
 
16
cegoe
DEFINIÇÕES para 2VA
  • projetos e acompanhamento
  • aulas
  • horários
  • avaliações
DEFINIÇÕES DE PROJETOS E ATIVIDADES PARA 2VA

17
-
tira-dúvidas


18
cegoe
STATUS REPORT dos projetos


19
-
tira-dúvidas

20
cegoe
STATUS REPORT dos projetos

21
-
tira-dúvidas

22
cegoe
NOTA 1 - 1os. resultados e definição de novos DEADLINES


23 -
tira-dúvidas

24 
cegoe

STATUS REPORT dos projetos


25-26
-
tira-dúvidas


27
-
tiradúvidas


 28  Como estruturar o artigo final no formato de submissão:
  1. REIC

Os melhores artigos serão submetidos ao ERMAC 2009
Orientação à escrita de artigos para submissão.
 
  1. A Arte de Escrever Artigos Científicos
  2. How To Organize Your Thesis
  3. O processo criativo e a tessitura de projetos acadêmicos de pesquisa
  4. Orientação a Alunos do Projeto Xiscanoé
  5. Dicas para uma boa elaboração de  Referências bibliográficas:
(Como fazer uma pesquisa bibliográfica - 1)

(Como fazer uma pesquisa bibliográfica - 2)

(Como fazer referência bibliográfica?)

29
por e-mail ou por solicitação
E-mailENTREGA DOS ARTIGOS formato REIC - Fechamento 2VA e 3VA

30
FINALFINALFINAL







Links and References


Papers about Epidemiology and Computational Modelling

Papers about Public Health